@article { author = {Mostafavi, Golaleh and Assadi, Mostafa and Mehregan, Iraj}, title = {Phylogeny of Ononis in Iran using nuclear ribosomal DNA and chloroplast sequence data}, journal = {Rostaniha}, volume = {17}, number = {2}, pages = {95-107}, year = {2016}, publisher = {IRIPP, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Tehran, IRAN}, issn = {1608-4306}, eissn = {2423-6608}, doi = {10.22092/botany.2017.109402}, abstract = {The genus Ononis,embraces more than 85 species worldwide. In the present study, materials of two subspecies of O. spinosa from different localities of Iran alongside some other native species of the genus were included in phylogenetic analyses. In addition, over 50 accessions were obtained from GenBank. In order to clarify the exact number of subspecies of O. spinosa in Iran, datasets were obtained from sequencing of nuclear ribosomal ITS (nr DNA ITS) and trnL-F plastid (cp DNA) regions and analysed. Three taxa belonging to O. spinosa L. complex (O. spinosa subsp. leiosperma, O. spinosa subsp. antiquorum, and O. arvensis=O. spinosa subsp. arvensis) were previously reported from Iran. Based on Maximum Parsimony and Bayesian analyses of the molecular datasets, it is shown that, unlike the previous reports, Iranian O. spinosa complex belongs to only two subspecies (i.e. leiosperma and arvensis subspp.). In addition, we also found that, O. spinosa subsp. antiquorum is not present in Iran. It was also demonstrated that, seed sculpturing does not provide valuable characters in diagnosing different subspecies of O. spinosa.}, keywords = {nrDNA ITS,Molecular Phylogeny,species diversity,Systematics,trnL-F}, title_fa = {تبارزایی جنس Ononis براساس توالی‌های DNA ریبوزومی هسته‌ای و کلروپلاستی در ایران}, abstract_fa = {جنس Ononis (باقلاییان)، دارای بیش از 85 گونه در سرتاسر دنیا می‌باشد. در مطالعه حاضر، مواد دو زیرگونه از نقاط متفاوت ایران به همراه تعدادی از گونه‌های بومی دیگر جنس مورد تحلیل فیلوژنتیکی قرار گرفتند. به علاوه، بیش از 50 توالی نیز از بانک ژن به دست آمد. به منظور تعیین تعداد دقیق زیرگونه‌های O. spinosa در ایران، مجموعه داده‌های حاصل از توالی‌‌یابی نواحی آی.تی.اس. از دی.ان.ای. ریبوزومی هسته‌ای و ناحیه پلاستیدی trnL-F (دی.ان.ای. کلروپلاستی) تحلیل شد. سه آرایه متعلق به کمپلکس گونه‌ایO. spinosa (O. spinosa subsp. leiosperma، O. spinosa subsp. antiquorum و O. arvensis=O. spinosa subsp. arvensis) قبلا از ایران گزارش شده بودند. براساس تحلیل‌های بیشینه صرفه‌جویی و استنباط بِیزیَن مجموعه داده‌های مولکولی، نشان داده شد که برخلاف گزارش‌های پیشین، کمپلکس گونه‌ای O. spinosa تنها متعلق به دو زیرگونه است (زیرگونه‌های leiosperma و arvensis). علاوه‌ بر این، مشخص شد که زیرگونه O. spinosa subsp. antiquorum در ایران نمی‌روید. همچنین، نشان داده شد که تزیینات سطح دانه نمی‌تواند صفات مناسبی را در تشخیص زیرگونه‌های مختلف O. spinosa تامین نماید.}, keywords_fa = {تبارزایی مولکولی,تنوع گونه‌ای,آی.تی.اس. ریبوزومی هسته‌ای,سیستماتیک,trnL-F}, url = {https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_109402.html}, eprint = {https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_109402_2f7e15ed197161dd234885eb44f10963.pdf} } @article { author = {Gholipour, Abbas and Sajedi, Sepideh and Amini Rad, Mohammad}, title = {Notes on Silene chustupica, a new record and occurrence of S. dianthoides in Iran replacing with S. marcowiczii}, journal = {Rostaniha}, volume = {17}, number = {2}, pages = {108-114}, year = {2016}, publisher = {IRIPP, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Tehran, IRAN}, issn = {1608-4306}, eissn = {2423-6608}, doi = {10.22092/botany.2017.109404}, abstract = {The genus Silene, with more than 100 species in Iran is an important genus of Iranian flora. According to available data on the northwestern parts of Iran, including three provinces of Ardabil, East and West Azarbaijan are considered as a major diversity center of perennial species of the genus Silene in Iran. In the course of a revision of Silene in this area, some interesting specimens were collected which are new records from Iran. In this paper, occurrence of Silene dianthoides (sect. Caespitosae), and S. chustupica (sect. Auriculatae) are reported. The name S. dianthoides is used for previous records of S. marcowiczii which is more likely conspecific. Both species are growing in alpine zone. The previously evaluated threatened status of S. chustupica as critically endangered according to IUCN red list categories is discussed here. The taxonomical descriptions, geographical distribution and the ecology of the new records are provided and their photographs are also presented.}, keywords = {Alpine,IUCN red list,sect. Auriculatae,sect. Caespitosae}, title_fa = {یادداشتی بر Silene chustupica، گزارش جدید و جایگزینی S. marcowiczii با S. dianthoides در ایران}, abstract_fa = {جنس Silene (Caryophyllaceae)، با بیش از 100 گونه، یکی از جنس‌های بزرگ فلور ایران محسوب می‌شود. مطابق اطلاعات موجود، شمال‌غرب ایران؛ استان‌های اردبیل، آذربایجان شرقی و غربی، از مراکز مهم تنوع گونه‌های چندساله این جنس در ایران محسوب می‌شوند. طی بازنگری گونه‌های این جنس در این منطقه، نمونه‌های جالبی جمع‌آوری شدند که گزارش‏های جدیدی برای فلور ایران هستند. در این مقاله Silene dianthoides و S. chustupica به ترتیب از بخش‌هایCaespitosae  و Auriculatae  به عنوان گزارش جایگزین S. marcowiczii و دومی به عنوان گزارش جدید برای فلور ایران معرفی می‌شود. این گونه‌ها گیاهانی چندساله و پشته‌ای بوده و در نواحی کوهسری می‌رویند. موقعیت گونه S. chustupica در طبقه‌بندی لیست سرخ IUCN که این گونه را به شدت در خطر انقراض معرفی کرده، مورد بحث قرار می‌گیرد. شرح گیاه‌شناسی، پراکنش جغرافیایی، اکولوژی و تصاویر هر یک از گونه‌ها نیز ارایه شده است.}, keywords_fa = {کوهسری,لیست سرخ IUCN,sect. Caespitosae,sect. Auriculatae}, url = {https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_109404.html}, eprint = {https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_109404_60d71cef1893229bf13d6dcf6b777d32.pdf} } @article { author = {Ghosta, Youbert and Poursafar, Alireza and Fathi Qarachal, Jafar}, title = {Study on coprophilous fungi: new records for Iran mycobiota}, journal = {Rostaniha}, volume = {17}, number = {2}, pages = {115-126}, year = {2016}, publisher = {IRIPP, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Tehran, IRAN}, issn = {1608-4306}, eissn = {2423-6608}, doi = {10.22092/botany.2017.109405}, abstract = {In a study on coprophilous fungi, different samples including cow, sheep and horse dung and mouse feces were collected from different locations in West and East Azarbaijan provinces (NW Iran). Isolation of the fungi was done based on moist chamber culture method. Purification of the isolated fungi was done by single spore culture method. Several fungal taxa were obtained. Identification of the isolates at species level was done based on morphological characteristics and data obtained from internal transcribed spacer (ITS) regions of ribosomal DNA sequences. In this paper, five taxa viz. Arthrobotrys conoides, Botryosporium longibrachiatum, Cephaliophora irregularis, Oedocephalum glomerulosum, and Podospora pauciseta, all of them belong to Ascomycota, are reported and described. All these taxa are new records for Iran mycobiota.}, keywords = {Ascomycota,Biodiversity,dung fungi,internal transcribed spacer,moist chamber}, title_fa = {مطالعه قارچ‌های کوپروفیل: ثبت‌های جدید برای بیوتای قارچی ایران}, abstract_fa = {در مطالعه‌‌ قارچ‌های کوپروفیل (سرگین‌دوست)، نمونه‌های مختلف از پهن گاو، گوسفند، اسب و فضله‌های موش، از مناطق مختلف در استان‌های آذربایجان غربی و شرقی جمع‌آوری شدند. جدا‌سازی قارچ‌ها براساس روش کشت در محفظه مرطوب انجام گرفت. خالص‌سازی جدایه‌های قارچ‌ها براساس روش تک‌هاگ کردن انجام گرفت. چندین آرایه‌ قارچی مختلف در این مطالعه به دست آمد. عمل شناسایی جدایه‌ها در سطح گونه براساس ویژگی‌های ریخت‌شناختی و اطلاعات به دست آمده از توالی‌یابی ناحیه آی.تی.اس. از دی.ان.ای ریبوزومی هسته‌ای انجام گرفت. در این مقاله، پنج آرایه شامل Arthrobotrys conoides, Botryosporium longibrachiatum, Cephaliophora irregularis, Oedocephalum glomerulosum و Podospora pauciseta به عنوان آرایه‌های جدید برای بیوتای قارچی ایران گزارش و توصیف می‌شوند.}, keywords_fa = {آسکومیکوتا,بخش رونویسی شونده داخلی,تنوع زیستی,قارچ‌های پهن‌دوست,محفظه مرطوب}, url = {https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_109405.html}, eprint = {https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_109405_cb33985a98a09cbfa5f5852b4d3acc73.pdf} } @article { author = {Samadi, Rosita and Arzanlou, Mahdi and Ghosta, Youbert and Houbraken, Jos}, title = {Three Penicillium species new for the mycobiota of Iran from soils of the National Park of Urmia Lake}, journal = {Rostaniha}, volume = {17}, number = {2}, pages = {127-135}, year = {2016}, publisher = {IRIPP, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Tehran, IRAN}, issn = {1608-4306}, eissn = {2423-6608}, doi = {10.22092/botany.2017.109407}, abstract = {In a survey on the biodiversity of Penicillium species in soils of the National Park of Urmia Lake (NW Iran), eight Penicillium isolates were isolated as members of the section Citrina. Based on a combination of cultural and morphological criteria, the isolates were identified as Penicillium anatolicum, P. sanguifluum,and P. sizovae. The identity of each species was further confirmed using sequence data of β-tubulin gene (BenA). Three species are reported and described here as new records for the mycobita of Iran.  }, keywords = {hypersaline soils,National Park of Urmia Lake,Penicillium,section citrina,Taxonomy}, title_fa = {معرفی سه گونه جدید پنیسیلیوم برای مایکوبیوتای ایران از خاک‌های پارک ملی دریاچه‌ ارومیه}, abstract_fa = {در مطالعه تنوع زیستی گونه‌های جنس پنیسیلیوم در خاک‌های پارک ملی دریاچه ارومیه، هشت جدایه پنیسیلیوم متعلق به بخش سیترینا جداسازی شدند. براساس ترکیبی از ویژگی‌های ریخت‌شناختی ماکروسکوپی و میکروسکوپی سه گونهPenicillium anatolicum، P. sanguifluum و P. sizovae از بخش سیترینا شناسایی شدند. هویت گونه­های شناسایی شده با استفاده از توالی ژن بتا- توبولین تایید گردید. هر سه گونه به عنوان گونه‌های جدید برای مایکوبیوتای ایران گزارش و توصیف می‌شوند. }, keywords_fa = {بخش سیترینا,پارک ملی دریاچه ارومیه,پنیسیلیوم,تاکسونومی,خاک‌های فوق شور}, url = {https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_109407.html}, eprint = {https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_109407_39e6137e1e969654ada85f30556a1703.pdf} } @article { author = {Sayadi, Sadaf and Mehrabian, Ahmadreza}, title = {Diversity and distribution patterns of Solanaceae in Iran: Implications for conservation and habitat management with emphasis on endemism and diversity in SW Asia}, journal = {Rostaniha}, volume = {17}, number = {2}, pages = {136-160}, year = {2016}, publisher = {IRIPP, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Tehran, IRAN}, issn = {1608-4306}, eissn = {2423-6608}, doi = {10.22092/botany.2017.109408}, abstract = {The increasing rate of irreversible damages to natural habitats has reinforced the need for gathering biodiversity fundamental data to conservation. Priority setting is the most important step in protection programs. Solanaceae as the the one of important economic families of eudicots distributed throughout North and South America, Europe, Africa, Asia, Australia, and the South Pacific. Up to now, little attention has been paid to the patterns and diversity centers of Solanaceae in Iran. The present study describes in as much detail as possible the spatial distribution, areas with greater species richness, and centers of diversity for taxa. An ecogeographical database was developed using the records that corresponds to 3123 herbarium specimens belong to 2560 localities. The localities were marked using ArcView version 3.2 (ESRI 2000) on geo-referenced maps (1/106) of Iran. The distribution patterns of the taxa were mapped per 1° × 1° universal transverse Mercator grid cells (100 km2 with the exception of boundary area). Threatened categories of Iranian Solanaceae, including CR (43.4%) and VU (34%), mainly (58.9%) distributed in Irano-Turanian phytochorion. Solanaceae represents the highest richness in the central Alborz, Zagros, Kopet Dagh and Makran Mountains based on recent criteria. The conservation value of habitats of Solanaceae in Iran ranges from 0.15 (in coastline of Persian Gulf) to 11.19 (in eastern Alborz).}, keywords = {Conservation management,plant diversity,priorities for conservation,red list of species}, title_fa = {الگوهای پراکنش تیره سیب‌زمینی در ایران: کاربرد در حفاظت و مدیریت رویشگاه‌ها با تاکید بر اندمیسم و تنوع در جنوب غرب آسیا}, abstract_fa = {افزایش نرخ آسیب‌ها به زیستگاه‌های طبیعی نیاز به تدوین اطلاعات پایه جهت حفاظت را تقویت نموده است. الویت، مهمترین فاکتور در برنامه‌های حفاظتی می‌باشد. تیره سیب‌زمینی به عنوان یکی از گروهای دولپه‌ای حقیقی دارای طیف گسترده‌ای از مصارف دارویی، وابستگان وحشی گیاهان زراعی و زینتی می‌باشد. این تیره شامل 55 گونه متعلق به نه جنس از شش طایفه در ایران است. مطالعه حاضر با هدف توصیف ویژگی‌های ژئوبوتانیکی، پراکنش فضایی، مناطق غنای گونه‌ای، مراکز تنوع و اندمیسم و همچنین گونه‌های نادر و در خطر انقراض با رویکرد ژئوبوتانیکی و حفاظت تبیین شده است. این پژوهش براساس ارزیابی 3123 نمونه ثبت شده از 2650 موقعیت جغرافیایی صورت پذیرفته است. این مناطق جغرافیایی در سلول‌های شبکه‌ای1° × 1°  (UTM) با مقیاس 100 کیلومتر مربع به استثنای منطقه مرزی برای تعیین الگوی پراکنش و مناطق مهم به منظور مدیریت حفاظت جهت تهیه نقشه‌ها مورد ارزیابی قرار داده شده است. طبقات تهدید آرایه‌های تیره سیب‌زمینی در ایران عبارتند از: بحرانی (4/43 درصد) و آسیب‌پذیر (34 درصد) که عمده آن‌ها (9/58) درصد در منطقه ایرانو-تورانی استقرار یافته است. نتایج این مطالعه نشان می‌دهد که بالاترین غنای گونه‌ای این تیره در کوه‌های البرز، زاگرس، کپه‌داغ و مکران تمرکز دارد. علاوه بر این، دامنه ارزش حفاظتی رویشگاه‌ها بین 15/0 (نوار ساحلی فارسی خلیج فارس و دریای عمان) تا 19/11 (البرز شرقی) متغیر می‌باشد.}, keywords_fa = {الویت‌های حفاظتی,تنوع گیاهی,فهرست سرخ گونه‌ها,مدیریت حفاظت}, url = {https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_109408.html}, eprint = {https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_109408_00d111259e98aac25e695945a662a8a9.pdf} } @article { author = {Nowruzi, Bahareh and Khavari-Nejad, Ramezan-Ali and Nejadsattari, Taher and Sivonen, Karina and Fewer, David}, title = {A proposal for the unification of two cyanobacterial strains of Nostoc as the same species}, journal = {Rostaniha}, volume = {17}, number = {2}, pages = {161-172}, year = {2016}, publisher = {IRIPP, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Tehran, IRAN}, issn = {1608-4306}, eissn = {2423-6608}, doi = {10.22092/botany.2017.109427}, abstract = {The present research aimed to investigate through a polyphasic approach, the differences in morphological and genotypic features of two cyanobacterial strains isolated from paddy fields of northern parts of Iran, belonging to the family Nostocaceae (subsect. IV. I). Based on the reliable identification keys, the two strains were identified as Nostoc ellipsosporum (Desm.) Rabenh. ex Born. et Flah, and N. muscorum Ag. ex Born. et Flah. Sequencing of cloned bacterial 16S rRNA fragment strongly indicated that, two Nostoc strains could not be discriminated by 16S rRNA and ITS genes sequencing and the current morphological classification of both is invalid. Moreover, phylogenetic study of two Nostoc strains has demonstrated that, genetic relationships are in conflict with the morphological classification. Besides, after doing DNA-DNA reassociation experiments, it was concluded that, two Nostoc strains investigated might possibly be united into one species. Finally, two Nostoc species were named as Nostoc sp. Bahar_E and Nostoc sp. Bahar_M, and have been registered under DDBJ, accession numbers: JF795278 and JF272482, respectively.}, keywords = {DNA-DNA hybridization,ITS,Morphology,Nostoc,16S rRNA}, title_fa = {پیشنهادی برای یکپارچه‌سازی دو سویه سیانوباکتری جنس نوستوک در قالب یک گونه}, abstract_fa = {هدف مطالعه حاضر این است که با استفاده از یک سری مطالعات چند منظوره، تفاوت‌های موجود در ویژگی‌های مورفولوژیک و ژنوتیپیک دو سویه سیانوباکتریای جدا شده از شالیزارهای برخی مناطق در شمال ایران که متعلق به تیره Nostocaceae (subsect. IV. I) هستند، بررسی شود. براساس کلیدهای شناسایی معتبر، دو سویه سیانوباکتری به اسامی Nostoc ellipsosporum(Desm.) Rabenh. ex Born. et Flah و N. muscorumAg. ex Born. et Flah شناسایی شدند. توالی‌یابی قطعه 16S rRNA کلون شده نشان داد که ژن‌های این قطعه و  ITSبا نتایج حاصل از تاکسونومی سنتی در دو گونه مذکور تطابق نداشته و رده‌بندی مورفولوژیکی در آن‌ها نامعتبر است. علاوه بر این، مطالعات فیلوژنتیکی دو سویه آشکار کرد که روابط ژنتیکی با رده‌بندی مورفولوژیکی همخوانی ندارد. همچنین، در نتیجه انجام آزمایش‌های هیبریداسیون DNA-DNA، مشخص گردید که دو سویه نوستوک مورد بررسی، احتمالا متعلق به یک گونه هستند. در نهایت دو گونه نوستوک، با نام‌هایNostoc sp. Bahar_E  و  Nostoc sp. Bahar_M و کدهای دسترسی JF795278  و JF272482 در بانک ژن ثبت شدند.}, keywords_fa = {مورفولوژی هیبریداسیون DNA-DNA,ITS,Nostoc,16S rRNA}, url = {https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_109427.html}, eprint = {https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_109427_d3c04cec11035eaeeb82945a5f69a957.pdf} } @article { author = {Sharifi, Kasra and Zare, Rasoul and Zamanizadeh, Hamid Reza and Mirabolfathy, Mansoureh and Rezaee, Saeed}, title = {Identification of Fusarium species associated with Fusarium head blight of wheat in the North of Iran and phylogenetic analysis of the dominant species}, journal = {Rostaniha}, volume = {17}, number = {2}, pages = {173-187}, year = {2016}, publisher = {IRIPP, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Tehran, IRAN}, issn = {1608-4306}, eissn = {2423-6608}, doi = {10.22092/botany.2017.109430}, abstract = {In order to determine the causal agents of Fusarium head blight, during 2015–16, wheat heads with disease symptom were collected from 10 and six main wheat production areas of Golestan and Mazandaran provinces (N Iran), respectively. A total of 431 Fusarium isolates were obtained belonging to nine Fusarium species based on their morphological characteristics. Fusarium graminearum species complex had the highest frequency among the species in both provinces, Golestan (52.0%) and Mazandaran (55.8%). Fusarium culmorum, F. equiseti, F. Acuminatum, and F. compactum had the highest mean of frequency in both provinces with 13.5, 9.7, 6.0 and 3.7%, respectively after F. graminearum. Also, F. cerealis, F. Avenaceum, and F. proliferatum and some unidentified isolates a total of 14% of the isolates were calculated. The lowest frequency was related to F. subglutinans (1%) that was isolated only from Golestan province. In order to determine the phylogeny of F. graminearum species complex in the North Iran, 53 out of 229 isolates were selected based on their distribution in the sampled areas. Partial genes of translation elongation factor 1-alpha (TEF) and putative reductase (RED) were amplified using specific primers. A commercial sequencing facility was used to generate fungal sequences. Almost all strains of F. graminearum species complex belonged to F. graminearum sensu stricto. The results indicated a homogeniety within F. graminearum species complex, however, there was a minor morphologically differences between some strains.}, keywords = {Fusarium graminearum,Golestan,Mazandaran,RED,TEF,wheat scab}, title_fa = {شناسایی گونه‌های فوزاریوم مرتبط با بلایت خوشه گندم و تجزیه فیلوژنتیکی گونه غالب در شمال ایران}, abstract_fa = {به ‌منظور تعیین عوامل بیماری بلایت فوزاریومی، خوشه‌های گندم با علایم بیماری از 10 و شش منطقه مهم کشت گندم به ترتیب از استان‌های گلستان و مازندران در سال زراعی 95-1394 نمونه‌برداری شد. براساس خصوصیات ریخت‌شناسی، 431 جدایه منسوب به فوزاریوم تشخیص داده شد که به نه گونه مختلف تعلق داشتند. گونه مرکب Fusarium graminearum بیشترین فراوانی را در استان‌های گلستان (52%) و مازندران (8/55%) داشت. قارچ‌های F. culmorum،F. equiseti،F. acuminatumوF. compactumپس از F. graminearum به ترتیب با میانگین‌های 5/13، 7/9، 6 و 7/3% در دو استان مذکور بیشترین فراوانی را داشتند. میانگین فراوانی F. cerealis، F. avenaceum،F. proliferatum و جدایه‌های شناسایی نشده در مجموع 14% در شمال ایران برآورد شد. کمترین فراوانی (1%) مربوط به قارچ F. subglutinans بود که فقط از نمونه‌های استان گلستان جدا شد. برای تعیین خصوصیات ریخت‌شناسی و فیلوژنتیکی گونه مرکب F. graminearum، 53 جدایه از بین 229 جدایه به دست آمده از استان‌های مذکور براساس مناطق انتشار انتخاب شد. بخشی از ژن‌های translation elongation factor 1-alpha (TEF) وreductase (RED)  با استفاده از آغازگرهای اختصاصی تکثیر و تعیین توالی شد. همه سویه‌های گونه مرکب F. graminearum متعلق به F. graminearum sensu stricto بودند. داده‌های فیلوژنتیکی نشان‌دهنده وجود همگنی ژنتیکی در بین جمعیت مربوط به گونه‌ مرکب F. graminearum بود، اگرچه بین بعضی از سویه‌های این گونه اختلافات کوچک ریخت‌شناسی وجود داشت.}, keywords_fa = {اسکب گندم,گلستان,مازندران,Fusarium graminearum,RED,TEF}, url = {https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_109430.html}, eprint = {https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_109430_3d820363a1e18f7750e80eeebfaffefe.pdf} } @article { author = {Heydarian, Motaharehsadat and Hatamian-Zarmi, Ashrafalsadat}, title = {Molecular identification of Ganoderma lucidum from Iran}, journal = {Rostaniha}, volume = {17}, number = {2}, pages = {188-192}, year = {2016}, publisher = {IRIPP, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Tehran, IRAN}, issn = {1608-4306}, eissn = {2423-6608}, doi = {10.22092/botany.2017.109434}, abstract = {Medicinal mushroom Ganoderma lucidum has been used in East Asia for centuries in order to prevent and treat a variety of diseases such as hepatitis, immunological disorders and cancers. In fact, this fungus contains a vast source of polysaccharides, proteins and secondary metabolites with anti-tumor and immuno-modulatory properties. Up to now, a variety of drug metabolites extracted from G. lucidum have reached the stage of commercial production. Recently, in addition to China, Korea and Japan, this valuable fungus has been identified in different parts of the world such as Pakistan, Malaysia and Turkey. In 2007, G. lucidum has been identified in northern forests of Iran; however, molecular identification of this fungus has not been reported yet. The aim of this study was, therefore, to identify this fungus collected from northern Iran by analyzing ITS-5.8S rDNA sequence. The result of this experiment confirmed that the collected specimen were G. lucidum.}, keywords = {Anti-tumor,fungus,ITS,north of Iran,Taxonomy}, title_fa = {شناسایی مولکولی Ganoderma lucidum در ایران}, abstract_fa = {قارچ دارویی Ganodermalucidum، قرن‌ها به منظور پیشگیری و درمان انواع بیماری‌ها از جمله هپاتیت، اختلالات ایمونولوژیک و سرطان در شرق آسیا مورد استفاده قرار گرفته است. در واقع، این قارچ شامل منبع عظیمی از پلی‌ساکاریدها، پروتئین‌ها و متابولیت‌های ثانویه با خواص ضدتومور و تنظیم‌کنندگی سیستم ایمنی است. تا به حال، انواع متابولیت‌های دارویی از این قارچ استخراج و به مرحله تولید تجاری رسیده است. در سال‌های اخیر، این قارچ ارزشمند علاوه بر چین، کره و ژاپن، در نقاط مختلف جهان از جمله پاکستان، مالزی و ترکیه شناسایی شده است. در سال 2007، برای نخستین بار قارچ مذکور در جنگل‌های شمال ایران شناسایی گردید ولی با این حال، تا کنون هویت مولکولی آن گزارش نشده است. هدف از این مطالعه، تایید هویت مولکولی قارچ جمع‌آوری شده از شمال ایران به کمک تجزیه و تحلیل توالی ITS-5.8S، DNA ریبوزومی است.}, keywords_fa = {رده‌بندی,شمال ایران,ضد تومور,قارچ,ITS}, url = {https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_109434.html}, eprint = {https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_109434_0143ef754bfc8fae51ad9f8ad5344edf.pdf} } @article { author = {Jamali, Samad and Alvarado, Pablo}, title = {First report of Rhizopogon roseolus in Iran}, journal = {Rostaniha}, volume = {17}, number = {2}, pages = {193-195}, year = {2016}, publisher = {IRIPP, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Tehran, IRAN}, issn = {1608-4306}, eissn = {2423-6608}, doi = {10.22092/botany.2017.109436}, abstract = {Rhizopogon is a hypogeous fungal genus that grows in an ectomycorrhizal symbiosis mostly with members of the Pinaceae family and its worldwide distribution correlates with natural and exotic Pinaceae forests. In Iran, Rhizopogon species have received scant attention from collectors in the past and have not been adequately collected. Few older studies, report the presence of R. luteolus (Saber 1999), and R. vulgaris in Iran (Ershad 2009). However, the accuracy of the species identification merely on the basis of morphological features is questionable. Rhizopogon roseolus is common in northwestern United States USA (Coker & Couch 1928, Harrison & Smith 1968). So far, it has been reported from, Finland (Schulmann 1955), Chile (Garrido 1986), Brazil (Baseia & Milanez 2002), Poland (Iwanski et al. 2006), Spain (Dominguez-Nunez et al. 2013) and New Zealand. In this study, seven specimens associated with roots of Pinus eldarica based on morphological and molecular characteristics were examined. Basidiocarps were hypogeous, globose, subglobose or irregular with different sizes (up to 10 cm in diam.) (Fig. 1A). Peridium was smooth and orange. Gleba was white to olive (Fig. 1B). Fresh mature basidiocarp not reacting in iodine. The basidia were club-shaped and 15–20 × 6–8 μm (Fig. 1C). Columella absent and paraphyses about 12–18 × 5–9 μm (Fig. 1D). The basidiospores ellipsoidal, smooth, hyaline, 6–8 × 3–4 μm, often contain two guttulae inside and falsely septate (Fig. 1E). All DNA sequences of Rhizopogon (accession numbers: KP202698 to KP202700) showed 100% homology with valid sequences previously identified and deposited in GenBank. Phylogenetic trees constructed based on ITS sequences showed that, all Iranian specimens are in the same branch in a clade with R. roseolus reported from other authors (Fig. 2). Rhizopogon roseolus, R. Burlinghamii,and R. vulgaris form distinct clades which were well-supported by bootstrap value (78% MP). This is the first report of R. roseolus and its host plant from Iran. }, keywords = {-}, title_fa = {نخستین گزارش از Rhizopogon roseolus در ایران}, abstract_fa = {Rhizopogonیک قارچ زیرزمینی است که به صورت قارچ-ریشه خارجی در همزیستی با اغلب اعضای تیره کاج‌ (Pinaceae) بوده و پراکنش جهانی آن همسو با جنگل‌های کاج است. در ایران، مطالعات کمی در خصوص Rhizopogon صورت گرفته و اطلاعات اندکی در مورد این قارچ در دسترس است. در مطالعه حاضر، هفت نمونهRhizopogon که همراه با ریشه گونه گیاهی  Pinus eldarica بودند، براساس خصوصیات مورفولوژیکی و مولکولی مورد بررسی قرار گرفتند. بر این اساس، تمام نمونه‌های دنبل دروغینRhizopogon همراه با ریشه این گونه گیاهی متعلق به جنسRhizopogon بودند. توالی دی.ان.ای. نمونه‌های Rhizopogon 100 درصد همولوژی با نمونه‌های معتبر ثبت شده در بانک ژن داشتند. درخت فیلوژنتیکی ترسیم شده براساس توالی‌های جداکننده نسخه‌برداری شده داخلی (آی.تی.اس.)، نشان داد که تمام نمونه‌های تحت بررسی با نمونه‌های معتبر مربوط به گونه Rhizopogon roseolus در یک شاخه با ضریب اطمینان بالا قرار گرفتند. این نخستین گزارش از وجود این گونه و میزبان آن در ایران است.}, keywords_fa = {-}, url = {https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_109436.html}, eprint = {https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_109436_1ba9f5acdb78f2490542e3f0557d674c.pdf} } @article { author = {Dadkhahipour, Kazem}, title = {Simple algorithm to assess the diversity and distribution for algae of Iran}, journal = {Rostaniha}, volume = {17}, number = {2}, pages = {196-197}, year = {2016}, publisher = {IRIPP, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Tehran, IRAN}, issn = {1608-4306}, eissn = {2423-6608}, doi = {10.22092/botany.2017.109438}, abstract = {By studying algae reports from different localities of the country during the past 87 years, about 6000 records information including 2567 species and infra-specifics were analyzed and distribution maps were drawn. The algae studies in the Iranian islands of the Persian Gulf, especially around Bushehr and the Khark Island by Borgesen (1930), the oldest available document is used in this study. Many of the scientific names of the references used were synonyms with authorities in the field of algae taxonomy, such as AlgaeBase (Guiry & Guiry 2015) were changed to valid names. Using the capabilities VB.Net programming (Foxall 2015) under a model of software named as “Explorer for Algae of Iran” was designed and developed.}, keywords = {-}, title_fa = {معرفی الگوریتم ساده برای بررسی تنوع و پراکنش جلبک‌های ایران}, abstract_fa = {با بررسی گزارش‌های معتبر از جلبک‌های نقاط مختلف کشور طی 87 سال اخیر، اطلاعات حدود 6000 رکورد دربرگیرنده تعداد 2567 گونه جلبک مورد ارزیابی قرار گرفت و نقشه پراکنش آن‌ها ترسیم گردید. هدف اصلی در این پژوهش، طراحی یک ابزار تحقیق برای پاسخگویی به پرسش‌های می‌باشد.}, keywords_fa = {-}, url = {https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_109438.html}, eprint = {https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_109438_5455012d7c31dd2855d0ba9b06884592.pdf} }