eng
IRIPP, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Tehran, IRAN
Rostaniha
1608-4306
2423-6608
2017-12-01
18
2
107
121
10.22092/botany.2018.115930
115930
مقاله پژوهشی
A taxonomic study of cyanobacteria in wheat fields adjacent to industrial areas in Yazd province (Iran)
مطالعه تاکسونومیک سیانوباکتریهای مزارع گندم مجاور مناطق صنعتی استان یزد
Maryam Ahlesaadat
1
Hossein Riahi
h-riahi@sbu.ac.ir
2
Zeinab Shariatmadari
3
Mohammad Hossein Hakimi Meybodi
4
MSc Student, Faculty of Life Sciences and Biotechnology, Shahid Beheshti University, G.C. Tehran, Iran
Prof., Faculty of Life Sciences and Biotechnology, Shahid Beheshti University, G.C. Tehran, Iran
Assistant Prof., Faculty of Life Sciences and Biotechnology, Shahid Beheshti University, G.C. Tehran, Iran
Assistant Prof., Faculty of Natural Resource, Yazd University, Yazd, Iran
Culturing, isolation, purification, and identification of cyanobacteria collected from wheat field soil, in five stations around the industrial areas in Yazd province (Iran) were conducted in this study. Identification of taxa was based on morphology and molecular methods. Cluster analysis and principal component analyses performed using SPSS software and rate of resemblance among the taxa were investigated. The phylogenetic analyses carried out according to 16S rRNA gene sequences data, and the phylogenetic relationships were assessed by Maximum Parsimony, Maximum Likelihood and Bayesian Inference. The results of this study indicated presence of 32 species included in four orders of cyanobacteria. Among these orders, Oscillatoriales with three families, eight genera and 13 species showed the highest species diversity, whereas Chroococcales with two families, three genera and four species, exhibited the lowest diversity. Among isolated taxa, Oscillatoria ornata, O. engelmanniana, Jaaginema pallidum, Pseudanabaena minima,Stenomitos frigidus, Nostoc edaphicum, and Gloeothece tepidariorum, are reported as new records for algal flora in Iran. Distributions and descriptions of the new taxa were also presented.
در این مطالعه، سیانوباکتریهای موجود در خاک مزارع گندم در پنج ایستگاه در مجاورت مناطق صنعتی استان یزد پس از طی مراحل کشت و خالصسازی مورد شناسایی قرار گرفتند. شناسایی نمونهها براساس ویژگیهای مورفولوژیک و نیز به روش مولکولی صورت گرفت. همچنین تجزیه خوشهای و تجزیه مولفههای اصلی با استفاده از نرمافزار SPSS صورت گرفت و قرابت میان آرایهها براساس صفات ریختی بررسی گردید. همچنین آنالیزهای فیلوژنتیک با استفاده از مارکر مولکولی 16S rRNA انجام و روابط فیلوژنتیک آرایهها براساس روشهای Maximum Parsimony، Maximum Likelihood و Bayesian ارزیابی گردید. حاصل این مطالعه، شناسایی 32 گونه از سیانوباکتریها بود که در چهار راسته مختلف قرار گرفت. راسته Oscillatoriales با سه تیره، هشت جنس و 13 گونه و راسته Chroococcales با دو تیره، سه جنس و چهار گونه به ترتیب از بیشترین و کمترین سطح تنوع برخوردار بودند. همچنین نتایج حاصل از این تحقیق، نشانگر کارآیی نسبی مارکر فیلوژنتیک (سکانس ژنی 16S rRNA) به کارگرفته شده و نیز کارایی مطالعات تاکسونومی عددی (آنالیز تجزیه خوشهای) در جداسازی آرایههای مورد مطالعه بود. ارزیابی چگونگی پراکنش گونههای شناسایی شده در ایستگاههای مطالعاتی و ارایه شرح آرایههای جدید برای فلور جلبکی ایران از دیگر یافتههای این مطالعه است. از میان آرایههای شناسایی شده، هفت گونه به اسامیO. ornata, Oscillatoria engelmanniana, Jaaginema pallidum, Pseudanabaena minima, Nostoc edaphicum, Gloeothece tepidariorum و Stenomitos frigidus برای نخستین بار از ایران گزارش میشوند.
https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_115930_1b6627ac8810cd6d88a3e00305aaf42f.pdf
cyanobacteria
Heavy metals
morphological diversity
new record
phylogenetic analyses
16S rRNA
آنالیز فیلوژنتیک
تنوع مورفولوژیکی
سیانوباکتری
فلزات سنگین
گونه جدید
16S rRNA
eng
IRIPP, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Tehran, IRAN
Rostaniha
1608-4306
2423-6608
2017-12-01
18
2
122
141
10.22092/botany.2018.115940
115940
مقاله پژوهشی
Multigene phylogeny and morphotaxonony of Septoria spp. from Iran along with a checklist of septoria-like taxa
فیلوژنی چندژنی و ریختشناسی گونههای جنس سپتوریا از ایران به همراه فهرستی از آرایههای شبهسپتوریا
Mounes Bakhshi
mounesbakhshi@gmail.com
1
Mahdi Arzanlou
arzanlou@tabrizu.ac.ir
2
Department of Botany, Iranian Research Institute of Plant Protection, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Tehran, Iran
Prof., Department of Plant Protection, Faculty of Agriculture, University of Tabriz, Tabriz, Iran
The genus Septoria includes important plant pathogens with worldwide distribution, commonly associated with leaf spots and stem cankers of a broad range of plant hosts. In this study, eight isolates of Septoria were recovered from leaves with leaf spot on four herbaceous and woody plants from Gilan, Ardebil, East and West Azerbaijan provinces in north and northwest of Iran. The isolates were studied by applying a polyphasic approach including morphological and cultural data, and multi-gene phylogeny (LSU, ITS, ACT, TEF1-α, CAL, TUB, and RPB2). They were then identified as Septoria convolvuli on Sonchus sp., S. protearum on Solanum pseudocapsicum, S. polygonorum on Punica granatum,and S. urticae on Urtica dioica. Septoria protearum represents a new record for the mycobiota of Iran. Moreover, this research reports Sonchus sp. as new host of S. convolvuli, Punica granatum as new host of S. polygonorum, and Solanum pseudocapsicum as new host of S. protearum worldwide. Additionally, a comprehensive literature-based checklist for 102 septoria-like species known to occur on different plant species in Iran was also provided. The complete annotated list covers 78 Septoria species, eight Stagonospora, seven Sphaerulina, four Zymoseptoria, two Phloeospora, one Caryophylloseptoria, one Parastagonospora, and one Stromatoseptoria.
جنس سپتوریا بیمارگرهای گیاهی مهمی را شامل میشود که در سراسر جهان پراکندهاند و اغلب با لکهبرگی و شانکر ساقه در دامنه گستردهای از میزبانهای گیاهی همراه هستند. در این پژوهش، هشت جدایه از این جنس از برگهای دارای علایم لکهبرگی میزبانهای چوبی و علفی از استانهای اردبیل، گیلان، آذربایجان شرقی و آذربایجان غربی به دست آمد. این جدایهها با استفاده از راهکار چندمنظری براساس ترکیب دادههای توالی هفت ناحیه ژنی (LSU، ITS، ACT، TEF1-α، CAL، TUB و RPB2)، دادههای میزبان و صفات ریختشناختی مورد بررسی قرار گرفتند. چهار گونه شامل Septoria convolvuli، S. protearum، S. polygonorum و S. urticae شناسایی شدند. این نخستین گزارش از وجود آرایه S. protearum برای میکوبیوتای ایران میباشد. همچنین، گیاه Sonchus sp. به عنوان میزبان جدیدی برای گونه S. convolvuli، انار (Punica granatum)، میزبان جدیدی برای گونه S. polygonorum و گیلاس مجلسی (Solanum pseudocapsicum) به عنوان میزبان جدیدی برای گونهS. protearum در سطح جهان معرفی میشوند. علاوه بر این، در این پژوهش، فهرست کاملی از 102 گونه سپتوریا و وابستگان آن که روی میزبانهای مختلف در ایران گزارش شدهاند، ارایه گردیده است. فهرست حاضر، دربردارنده 78 گونه Septoria، هشت گونه Stagonospora، هفت گونه Sphaerulina، چهار گونه Zymoseptoria، دو گونه Phloeospora، یک گونه Caryophylloseptoria یک گونه Parastagonospora و یک گونه Stromatoseptoria میباشد.
https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_115940_ebcdff40abe949d2bc1e3bf1c84b4557.pdf
Leaf spot
Mycosphaerella
phylogeny
plant pathogens
Systematic
بیمارگر گیاهی
سیستماتیک
فیلوژنی
لکهبرگی
میکوسفرلا
eng
IRIPP, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Tehran, IRAN
Rostaniha
1608-4306
2423-6608
2017-12-01
18
2
142
149
10.22092/botany.2018.115945
115945
مقاله پژوهشی
Prometheum rechingeri, a new report from Iran
Prometheum rechingeri، گزارشی جدید برای فلور ایران
Mohammad Amini Rad
aminirad2000@yahoo.co.uk
1
Urs Eggli
urs.eggli@zuerich.ch
2
Abbas Gholipour
e-mail: abbas.gholipuor@gmail.com
3
Research Assistant Prof., Department of Botany, Research Institute of Forests and Rangelands, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Tehran, Iran
Researcher, Wissenschaftlicher Mitarbeiter, Sukkulenten-Sammlung Zürich/Grün Stadt Zürich, Mythenquai 88, CH-8002 Zürich, Switzerland
Associate Prof., Department of Biology, Payame Noor University, Tehran, Iran
In the course of the study of collected specimens from West Azerbaijan province (NW Iran), Prometheum rechingeri (Crassulaceae) is reported for the first time from Iran. Based on recent phylogenetic and morphological studies in Crassulaceae family, genus Prometheum was considered as independent genus. So far, two species viz. P. pilosum (under Sedum pilosum), and P. sempervivoides (under S. sempervivoides) has been reported from Iran. These two species and the new report are specific to mountains regions and they mostly occur at elevation above 2000 m.s.l. in the northwest of Iran (West and East Azerbaijan provinces). A short discussion on the taxonomic history of the genus Prometheum and the relative species, description, distribution, illustration, ecology and a key for existing three Iranian species is provided.
تیره گل ناز (Crassulaceae)، دارای 33 تا 34 جنس و 1440 تا 1500 گونه در دنیا میباشد که اکثر گیاهان این تیره گوشتی میباشند (Eggli et al. 1995, Thiede & Eggli 2007). از این تعداد، شش جنس و 34 گونه در ایران رویش دارند (Akhiani 2000, Joharchi & Akhani 2006). اخیرا،Prometheum (A. Berger) H. Ohba توسط اوهبا (Ohba 1978) با داشتن هشت گونه، به عنوان جنسی مستقل از Sedum L. در نظر گرفته شده است که شواهد مولکولی نیز این جدایی را تایید میکند. جنس مذکور عنصر ایرانو-تورانی است و در شمال یونان، ترکیه، ارمنستان، ناحیه قفقاز، شمالشرق عراق و شمالغرب ایران پراکنش دارند. از این جنس تا به حال، دو گونهP. pilosum (M. Bieb.) H. Ohba تحت نامSedum pilosum M. Bieb. وP. sempervivoides (M. Bieb.) H. Ohba با نامSedumsempervivoides M. Bieb. از ایران گزارش شده است. براساس سه نمونه جمعآوری شده از استان آذربایجانغربی،Prometheumrechingeri (C.-A. Jansson) 't Hart برای نخستین بار از ایران گزارش میشود. این دو گونه به همراه P. rechingeri، گیاهانی مختص نواحی مرتفع کوهستانی بوده و اغلب در ارتفاعات بالای 2000 متر از سطح دریا در شمالغرب کشور (استانهای آذربایجانشرقی و غربی) پراکنش دارند. در این مقاله، توضیحاتی مختصر در مورد تاریخچه تاکسونومی این جنس و گونههای آن به همراه شرح مورفولوژیکی و تصاویر مربوط توضیح داده شده است. همچنین، کلید شناسایی برای سه گونه موجود از این جنس در ایران نیز تهیه و ارایه گردیده است.
https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_115945_077dcefe66dc882f2992342212a42fc4.pdf
Alpine
Crassulaceae
diversity
floristic
Rosularia
تنوع
تیره گل ناز
فلوریستیک
کوهسری
Rosularia
eng
IRIPP, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Tehran, IRAN
Rostaniha
1608-4306
2423-6608
2017-12-01
18
2
150
165
10.22092/botany.2018.115953
115953
مقاله پژوهشی
Introduction of some species of Parastagonospora on poaceous plants in Iran
معرفی گونههایی از جنس Parastagonospora روی گیاهان تیره گندمیان در ایران
Fariba Ghaderi
fghaderi2003@yahoo.com
1
Bahram Sharifnabi
sharifnabib@gmail.com
2
Mohammad Javan-Nikkhah
3
PhD Student, Department of Plant Protection, College of Agriculture, Isfahan University of Technology, Isfahan, Iran
Prof., Department of Plant Protection, College of Agriculture, Isfahan University of Technology, Isfahan, Iran
Prof., Department of Plant Protection, University College of Agriculture and Natural Resources of Tehran University, Karaj, Iran
The main purpose of this study was to identify species of Parastagonospora in association with poaceous plants in Iran. Some species of Parastagonospora like P. nodorum causes a major loss to wheat production in the world. In the present research, two species including P. nodorum,and P. avenae were identified from different poaceous species. Parastagonospora nodorum was identifiedonPhalaris arundinacea. However, P. avenae was divided into two formaespecialsi.e. P. avenae f. sp. avenaria (Paa)onPhalaris arundinacea and Avena sativa, and the identified P. avenae f. sp. tritici5 (Pat5) onPhalaris arundinacea, Bromus hordeaceus and Aegilops tauschii. Species identification was done according to morphology of anamorph and molecular confirmation was performed on the basis of ß-xylosidase gene sequence. Pat5 and Paa are reported from Iran for the first time and also all of the identified hosts are new to the world.
این مطالعه، با هدف شناسایی گونههای Parastagonospora مرتبط با گیاهان تیره گندمیان در ایران انجام شده است. برخی گونههای جنس ParastagonosporaمانندP. nodorum ، خسارت قابل ملاحظهای به این محصول در دنیا وارد میکنند. در این تحقیق، دو گونه از جنس Parastagonospora شامل P. nodorumوavenae P. روی گندمیان شناسایی شدند. گونه P. nodorum از روی Phalaris arundinacea شناسایی شد. گونهavenae P. نیز به دو گروه تقسیم شد که گروه اول آن، P. avenae f. sp. avenaria (Paa) از روی Phalaris arundinaceaوAvena sativaوگروه دوم،P. avenae f. sp. tritici5 (Pat5) از روی Phalaris arundinacea، Bromus hordeaceusوAegilops tauschiiشناسایی شد. شناسایی این گونهها براساس مشخصات ریختشناسی مرحله غیرجنسی و تایید مولکولی آنها براساس توالییابی ژن بتا زایلوسیداز انجام گرفت. گروههای Pat5 و Paa برای نخستین بار از ایران گزارش میشوند و همچنین تمامی گندمیان مورد مطالعه در این تحقیق، به عنوان میزبانهای جدید برای گونههای گزارش شده معرفی میشوند.
https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_115953_a44af5e874b92a9f0c156d097eb21b05.pdf
ß-xylosidase
glum blotch
Morphology
new species
phylogeny
بتا زایلوسیداز
ریختشناسی
سوختگی خوشه
فیلوژنی
گونه جدید
eng
IRIPP, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Tehran, IRAN
Rostaniha
1608-4306
2423-6608
2017-12-01
18
2
166
180
10.22092/botany.2018.115954
115954
مقاله پژوهشی
Models for estimating phytoplankton population densities under different environmental conditions with emphasis on climatic factors
ارایه مدلهایی برای تخمین تراکم جوامع فیتوپلانکتونی متاثر از شرایط محیطی با تاکید بر عوامل اقلیمی
Zahra Aghashariatmadary
zagha@ut.ac.ir
1
Zeinab Shariatmadari
z_shariat@sbu.ac.ir
2
Taher Nejadsattari
t.nejadsattari@srbiau.ac.ir
3
Assistant Prof., Department of Irrigation and Reclamation Engineering, University of Tehran, Karaj 31587-77871, Iran
Assistant Prof., Faculty of Life Sciences and Biotechnology, Shahid Beheshti University, G.C. Tehran, Iran
Associate Prof., Department of Biology, Faculty of Sciences, Islamic Azad University, Research and Science Branch, Tehran, Iran
The aim of this study is to determine the effect of environmental conditions with emphasis on the main meteorological factors (air temperature variables, sunshine hour, and humidity), on phytoplankton communities. As important primary producers in aquatic ecosystems, phytoplankton communities could be affected by several factors. Environmental factors play the major role in occurrence and diversity of these photosynthetic microorganisms. In the present study, the relationship between phytoplankton occurrence and meteorological variables was assessed in several artificial ponds and lakes in the National Botanical Garden of Iran. For this purpose, surface water samples of the selected sites were monthly studied over a year. A total of 122 taxa of phytoplanktons were identified in the mentioned sites out of which, five taxa were new records for Iran. Among several taxa, six dominant genera, including Chroococcus (Cyanophyta), Nitzschia (Bacillariophyta), Glenodinium (Pyrrhophyta), Scenedesmus, Cosmarium, and Tetraedron (Chlorophyta), were selected for further investigation. The meteorological factors were considered with emphasis on air temperature variables (maximum and minimum temperatures, average air temperature, wet and dry temperatures, and dew point temperature), sunshine hour, and humidity. Results showed that, climatic conditions can be considered as effective factors on phytoplankton communities. The results of regression analysis between algal density and meteorological variables showed that, phytoplankton’s density has a significant correlation with the sunshine hour and air temperature variables. It seems that, the regression equation and environmental sensitivity vary from one taxon to another.
جوامع فیتوپلانکتونی، به عنوان گروه مهمی از تولیدکنندگان اولیه در اکوسیستمهای آبی، تحت تاثیر عوامل مختلفی قرار دارند. بیتردید فاکتورهای محیطی نقش مهمی در فراوانی و تراکم این میکروارگانیسمهای فتوسنتزکننده اعمال مینمایند. در این مطالعه، ارتباط میان فراوانی جوامع فیتوپلانکتونی و متغیرهای هواشناسی، در تعدادی از اکوسیستمهای آبی واقع در باغ گیاهشناسی ملی ایران (مؤسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشور، تهران) مورد ارزیابی قرار گرفت. به این منظور، نمونههایی از آب سطحی اکوسیستمهای آبی مورد نظر به صورت ماهانه و به مدت یک سال بررسی گردید. در مجموع، 122 آرایه فیتوپلانکتونی شناسایی شد که از آن میان، پنج آرایه برای نخستین بار از ایران گزارش میشوند. به منظور ارزیابی چگونگی تاثیرپذیری جوامع فیتوپلانکتونی از متغیرهای هواشناسی، شش جنس غالب از اکوسیستمهای مورد نظر به اسامی (Cyanophyta) Chroococcus، Nitzschia (Bacillariophyta)، Glenodinium (Pyrrhophyta)، Scenedesmus، Cosmarium و (Chlorophyta) Tetraedronمورد بررسی قرار گرفتند. از جمله متغیرهای هواشناسی مورد مطالعه میتوان به متغیرهای دمایی (دمای بیشینه و کمینه، دمای میانگین، دمای خشک و مرطوب و دمای شبنم)، تعداد ساعات آفتابی و شرایط رطوبتی اشاره نمود. نتایج این مطالعه نشان داد که عوامل اقلیمی از جمله عوامل مهم تاثیرگذار بر جوامع فیتوپلانکتونی هستند. همچنین، نتایج تحلیل وایازشی (آنالیز رگرسیون) تراکم جلبکی و متغیرهای هواشناسی نشان داد که تراکم فیتوپلانکتونی دارای همبستگی معنیداری با تعداد ساعات آفتابی و متغیرهای دمای هوا میباشد. از دیگر نتایج مطالعه حاضر، میتوان به اختلاف روابط وایازشی (رگرسیون) و حساسیتهای محیطی نمونههای مختلف در مقایسه با یکدیگر نیز اشاره نمود.
https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_115954_3ee622591838da818b416f1fc1e43fca.pdf
Algal flora
freshwater ecosystem
Light intensity
meteorology
population density
اکوسیستم آب شیرین
تراکم جمعیت
شدت تابش
فلور جلبکی
هواشناسی
eng
IRIPP, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Tehran, IRAN
Rostaniha
1608-4306
2423-6608
2017-12-01
18
2
181
197
10.22092/botany.2018.115955
115955
مقاله پژوهشی
Distribution patterns of Convolvulaceae in Iran: priorities for conservation
الگوی پراکنش تیره پیچک در ایران: الویتهای حفاظتی
Sadaf Sayadi
sadaf_sayadi@yahoo.com
1
Ahmadreza Mehrabian
a_mehrabian@sbu.ac.ir
2
MSc Student, Department of Plant Sciences and Biotechnology, Faculty of Life Sciences and Biotechnology, Shahid Beheshti University, GC, Tehran, Iran
Assistant Prof., Department of Plant Sciences and Biotechnology, Faculty of Life Sciences and Biotechnology, Shahid Beheshti University, GC, Tehran, Iran
Assessing priorities is the most important action in conservation programs. Rudimentary, mapping of diversity, and distribution patterns have been used to set priorities on diverse scales. The distribution patterns of plant taxa, largely reflect an actual ecological niche. Convolvulaceae s.str exhibits cosmopolitan dispersal of diverse life forms and includes 50–60 genera comprising 1600–1700 species including valuable ornamental, medicinal and food crops as well as weedy taxa. Little attention has been paid to the patterns and diversity centers of this family in scale of Iran and Asia. The present study, explains in as much detail as possible distribution patterns and the priorities for conservation of Convolvulaceae in the context of species and habitats in Iran. Threatened species of Iranian Convolvulaceae include 20.4% distributed in the Irano-Turanian phytochorion as a priority region for conservation planning. Moreover, this family represents the highest richness in the Alborz and central Zagros mountains of Iran. A meaningful proportion of priority taxa and habitats are located in protected areas of Iran. Regardless, some face several threatening factors (e.g. land use change, deforestation, and overgrazing) outside protected areas; therefore, emergent conservation actions (in situ and ex situ methods) appear necessary to protect these taxa.
ارزیابی الویتها مهمترین اقدام در برنامههای حفاظتی محسوب میشود. تهیه نقشه تنوع و الگوهای انتشار به صورت متداولی در پایهریزی الویتها در مقیاسهای متنوع به کار گرفته شده است. تیره پیچک در مفهوم محدود شده نمایانگر یک الگوی انتشار جهانوطن متشکل از اشکال متنوع زیستی و مشتمل بر 50-60 جنس از 1700-1600 گونه میباشند. تا کنون، مراکز تنوع و انتشار این تیره در مقیاس ایران و آسیا کمتر مورد توجه قرار گرفته است. این مطالعه بیانگر دقیق الگوهای انتشار و الویتهای حفاظتی در قالب زیستگاهی و گونهای در تیره مذکور در کشور میباشد. گونههای در معرض تهدید این تیره در ایران 4/20 درصد میباشد که غالبا در مناطق ایرانو-تورانی اکوسیستم البرز و زاگرس انتشار یافتهاند. این در حالی است که بیشترین تنوع تیره مورد نظر نیز در این مناطق استقرار یافته است. به علاوه، تعداد زیادی از آرایهها در محدوده مناطق تحت حفاظت قرار میگیرند. علیرغم این، در خارج از مناطق حفاظت شده با چالشهای متعددی چون تغییرات کاربری اراضی، پاکتراشی جنگل و چرای بیرویه در زیستگاههایشان مواجه هستند. بنابراین، اقدامات حفاظتی سریع (مشتمل بر حفاظت داخل و خارج از زیستگاه) جهت حفاظت از آنها بسیار ضروری به نظر میرسد.
https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_115955_dec5852c36e7a9030cb7a4670f1543cc.pdf
Conservation management
distribution map
phytogeography
rare species
Species richness
جغرافیای گیاهی
غنای گونهای
گونههای نادر
مدیریت حفاظتی
نقشه انتشار
eng
IRIPP, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Tehran, IRAN
Rostaniha
1608-4306
2423-6608
2017-12-01
18
2
198
209
10.22092/botany.2018.115956
115956
مقاله پژوهشی
Micromorphological study of the tribe Agrimonieae family Rosaceae in Iran
مطالعه ریزریختشناسی برگ طایفه Agrimonieae از تیره گلسرخیان در ایران
Marzieh Beygom Faghir
marziehbeygomfaghir@gmail.com
1
Golnoush Shamshiri
golnoush.shamshiri@gmail.com
2
Atefeh Mehrmanesh
at.mehrmanesh@gmail.com
3
Assistant Prof., Department of Biology, Faculty of Science, University of Gilan, Rasht, Iran
MSc Student, Department of Biology, Faculty of Science, University of Gilan, Rasht, Iran
MSc Student, Department of Biology, Faculty of Science, University of Gilan, Rasht, Iran
The current study, devoted to leaf micromorphology of tribe Agrimonieae in Iran including three genera (Agrimonia, Aremonia,and Sanguisorba),four species (Agrimonia eupatoria,Aremonia agrimonioides,S. minor, and S. officinalis), and six subspecies (A. eupatoria subsp. eupatoria, A. eupatoria subsp. grandis, A. eupatoria subsp. asiatica, S. minor subsp. minor, S. minor subsp. lasiocarpa, and S. minor subsp. muricata). At first, plant materials were collected and identified and then leaf segments were washed and prepared for Scanning Electron Microscopy (SEM). The result of micromorphological analysis revealed three types of trichomes (curved, flexuous and straight), four types of hair surface ornamentations (echinate, transversely elongated papilla, verucate and granulate), and two types of glandular hairs (round to cylindrical head cell with pisilate to echinate surfaces). In all the examined species, epicuticulare wax types were either of film (smooth layers and crust), and crystalloids (granule and platelets), and wax sculpturing which comprises four types of syntupism. In addition, stomata traits were identified especially three types of outerstomatal rim/peristomatal rim, four types of inner stomata rim, and three types of wax distribution on the stomata rim/pore/epidermal cell. Based on author’s achievements, micromorphological characters of studied species of tribe Agrimonieae, possess diagnostic value and were capable of separating different taxonomic ranks (subtribes, genera, species, and subspecies). Based on these characters, an identification key is also prepared and presented herewith.
مطالعه حاضر به مطالعه صفات ریزریختشناسی برگ گیاهان طایفهAgrimonieae (syn.: Sanguisorbeae DC.)، شامل سه جنس (Agrimonia، AremoniaوSanguisorba)، چهار گونه (Agrimonia eupatoria، Aremonia agrimonioides،S. minor و officinalisS.)، شش زیرگونه (A. eupatoria subsp. eupatoria، A. eupatoria subsp. grandis، A. eupatoria subsp. asiatica، S. minor subsp. minor، S. minor subsp. lasiocarpa و S. minor subsp. muricata) میپردازد. ابتدا نمونههای گیاهی جمعآوری و شناسایی و سپس قطعات برگ شستشو و برای عکسبرداری توسط میکروسکوپ الکترونی (SEM)آماده شدند. نتایج حاصل از آنالیز ریزریختشناسی، سه نوع کرک (خمیده، موجدار و راست)، چهار نوع تزیینات سطح کرک (خار مانند، پشتههای عرضی، زگیلدار و گرانولدار، دو نوع کرک غدهای (سر گرد و استوانه، با سطح صاف تا خاردار)، دو نوع موم روی کوتیکولی لایه نازک (لایهای صاف و پوسته پوسته) و کریستالوییدی (گرانولدار، صفحات کوچک) و چهار الگوی ترکیبی تزیینات موم را آشکار ساخت شد. به علاوه، در این مطالعه، صفات روزنه بویژه سه نوع الگوی لبه بیرونی/تقریبا درونی و چهار نوع لبه درونی روزنه و سه الگوی پراکنش موم روی لبه درونی روزنه/سلولهای منفذ/سلولهای نگهبان شناسایی شدند. براساس یافتههای این تحقیق، صفات ریزریختشناسی گونههای مورد بررسی طایفه Agrimonieaeحاوی اطلاعات تشخیصی و برای جداسازی سطوح مختلف تاکسونومیک (زیرطایفه، جنس، گونهها و زیرگونهها) کارآمد میباشند. براساس این صفات، کلید شناسایی نیز تهیه و ارایه گردید.
https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_115956_675ba93dd44ab10872a94894b491c678.pdf
Agrimonia
Aremonia
epicuticular wax
leaf blade
Sanguisorba
SEM
trichome
پهنک برگ
SEM
کرک
موم روی کوتیکولی
Agrimonia؛ Aremonia؛ Sanguisorba
eng
IRIPP, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Tehran, IRAN
Rostaniha
1608-4306
2423-6608
2017-12-01
18
2
210
221
10.22092/botany.2018.115958
115958
مقاله پژوهشی
Molecular phylogenetic and morphometric evaluation of Calothrix sp. N42 and Scytonema sp. N11
ارزیابی فیلوژنی مولکولی و مورفومتریک Calothrix sp. N42 و Scytonema sp. N11
Bahareh Nowruzi
bahare77biol@yahoo.com
1
Hossein Fahimi
2
Neda Ordodari
3
Assistant Prof., Department of Biology, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran
Assistant Prof., Department of Molecular and Cellular Sciences, Faculty of Advanced Sciences & Technology, Pharmaceutical Sciences Branch, Islamic Azad University (IAUPS), Tehran, Iran
MSc Student, Pharmaceutical Sciences Research Center, Pharmaceutical Sciences Branch, Islamic Azad University (IAUPS), Tehran, Iran
The taxonomy of cyanobacteria has been substantially modified in the last few decades, particularly after application of modern ultra structural and molecular methods. The present research, therefore, aimed to investigate, through a polyphasic approach, the differences in morphological and genotypic features of two cyanobacteria strains isolated from different agricultural and freshwaters areas in Kermanshah province (W Iran). In fact, identification and taxonomy of both Calothrix sp. N42 and Scytonema sp. N11 was problematic and confusing. Challenges arose when the two strains seemed to be Calothrix, because of early unbranched filaments, narrow cells and ending by heterocysts. Along with the progression of growth, branching arise. Therefore, molecular analysis was made and morphometric and genetic (16S rRNA) data were used to characterize the strains in liquid suspension cultures and solid media under photoautotrophic conditions. The results of sequencing the 16S rRNA fragment and phylogenetic comparison strongly indicated that, two strains fall into different phylogenetic clusters. Theywere named as Calothrix sp. N42 and Scytonema sp. N11 and have been registered under DDBJ, accession number KY548062 and KY548065, respectively.
مطالعه گونههای سیانوباکتریایی، به خصوص اعضای راستهNostocales ، به دلیل برخورداری از قابلیت تثبیت نیتروژن اتمسفری و در نتیجه نقش آنها در باروری خاکهای کشاورزی در سراسر جهان، در جوامع علمی از اهمیت بسیاری برخوردار است. با این حال، به رغم اهمیت اکولوژیکی، تاکسونومی سیانوباکتریها هنوز دارای پیچیدگیهای بسیار است چرا که مطالعات تاکسونومیک سیانوباکتریها، به دلیل ویژگیهای مورفولوژیکی و فیزیولوژیکی، در شرایط مختلف بسیار متنوع بوده و این مسئله موجب بروز اختلالات زیادی در سیستمهای طبقهبندی شده است. تاکسونومی سیانوباکتریها، در دهههای اخیر، بویژه بعد از کاربرد روشهای مولکولی و فراساختاری، به طور قابل توجهی تغییر کرده است. هدف از مطالعه حاضر این است که از طریق مطالعه پلیفازیک، تفاوت ویژگیهای مورفولوژیک و ژنوتیپیک دو سویه سیانوباکتری جداسازی شده از زمینهای زراعی و اکوسیستمهای آب شیرین در استان کرمانشاه، مورد بررسی قرار گیرد. در حقیقت، شناسایی و تاکسونومی Calothrix sp. N42 و Scytonema sp. N11 جدا شده از ایستگاههای مطالعاتی مختلف واقع در استان کرمانشاه، دارای پیچیدگیهای بسیاری بود، چرا که دو سویه در شناساییهای اولیه مورفولوژیک، به علت فیلامنتهای غیرمنشعب، سلولهای باریک و حضور هتروسیست در انتهای ریسه، Calothrixبه نظر میرسیدند، اما با رشد بیشتر، ریسهها منشعب شدند. بنابراین، آنالیزهای مولکولی و مورفومتریک با استفاده از اطلاعات ژنتیکی حاصل از16S rRNA برای شناسایی سویهها، در کشتهای مایع و جامد در شرایط فتواتوتروفیک انجام گرفت. نتایج حاصل از مقایسه توالی قطعات 16S rRNA و فیلوژنتیک نشان داد که دو سویه، در دو کلاستر فیلوژنتیکی متفاوت قرار میگیرند، لذا با نامهای Calothrix sp. N42 و Scytonema sp. N11 در DDBJ به ترتیب با کدهای دسترسی KY548062 و KY548065 ثبت شدند.
https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_115958_f04c62a55b5e0dd20e8ddbc57db81e67.pdf
Calothrix sp. N42
Nostocales
phylogenetic approaches
Scytonema sp. N11
Taxonomy
ارزیابیهای فیلوژنتیک
تاکسونومی
Calothrix sp. N42
Nostocales
Scytonema sp. N11
eng
IRIPP, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Tehran, IRAN
Rostaniha
1608-4306
2423-6608
2017-12-01
18
2
222
226
10.22092/botany.2018.116006
116006
مقاله پژوهشی
First report of Ambrosia psilostachya from Iran: An invasive plant species establishing in coastal area of Gilan province (N Iran)
نخستین گزارش Ambrosia psilostachya از ایران، گونه گیاهی مهاجم در منطقه ساحلی استان گیلان
Somayeh Tokasi
stokasi@yahoo.com
1
Ebrahim Kazerooni Monfared
e_kazerooni@yahoo.com
2
Bijan YaghoubI
byaghoubi2002@yahoo.com
3
Mostafa Oveisi
moveisi@ut.ac.ir
4
Hamidreza Sasanfar
5
Hamid Rahimian Mashhadi
hrahimian@hotmail.com
6
Heinz Müller-Scharer
7
Assistant Prof. of Gilan Agricultural and Natural Resources Research and Education Center
Assistant Prof., University of Applied Science and Technology, Gilan, Rasht
Research Assistant Prof., Rice Research Institute of Iran, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Rasht, Iran
Associate Prof., Department of Agronomy and Plant Breeding, University of Tehran, Tehran, Iran
Researcher, Iranian Research Institute of Plant Protection, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Tehran, Iran
Prof., Department of Agronomy and Plant Breeding, University of Tehran, Tehran, Iran
Prof., Department of Biology, University of Fribourg, Switzerland
The genus Ambrosia consisting at least 40 species, with numerous intraspecific taxa (Essl et al. 2015). The first observation of Ambrosia from Iran was reported by Mozaffarian (1991). He reported distribution of A. artemisiifolia L.in Bandar-e Anzali (Gilan province, N Iran). Expanding new colonies of Ambrosia species were increasingly observed from road-sides and coastal areas of Bandar-e Anzali in 2014.
جنس آمبروزیا، دارای 40 گونه در دنیا میباشد (Essl et al. 2015). حضور گونهDC. A. artemisiifolia در سال 1991 در بندر انزلی (استان گیلان) گزارش شد (Mozaffarian 1991). طی سه سال اخیر، در مناطق زیادی از حاشیه جادهها و زمینهای رها شده، پراکندگی وسیعی از گیاه آمبروزیا مشاهده شده است. گمانهزنی اولیه این بود که گونه A. artemisifoliaدر گیلان و به خصوص بندر انزلی گسترش یافته است، اما جمعآوری نمونههای گیاهی و بررسی دقیق براساس کلیدهای معتبر شناسایی نشانگر حضور گونهای جدید با نام Ambrosia psilostachya DC.بود که سطح گسترش آنها حدود دهها هکتار در اراضی بایر منطقه تخمین زده میشد. نمونههای گیاهی و بذور آنها در سالهای 96–1395 جمعآوری شد و مطالعاتی روی آنها در مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان گیلان انجام گرفت. با مقایسه فلور منطقه با سالهای پیشین، مشخص گردید که این گیاه، زیستگاه گیاهان علوفهای اراضی مرتعی را به میزان زیادی تسخیر نموده و به دلیل دایمی بودن، ارتفاع بلندتر و طول دوره رشد طولانیتر، دارای غالبیت در بیشتر فلور بومی منطقه بوده و سبب تسخیر زیستگاه گیاهان بومی و همچنین ایجاد محدودیت در تامین علوفه برای دام میشود.
https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_116006_1eadb97ff629576f3514036c88521ee6.pdf
--
--
eng
IRIPP, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Tehran, IRAN
Rostaniha
1608-4306
2423-6608
2017-12-01
18
2
227
228
10.22092/botany.2018.116007
116007
مقاله پژوهشی
First report of Tuber aestivum var. uncinatum from Iran based on morphological and molecular characteristics
نخستین گزارش از Tuber aestivum var. uncinatum از ایران مبتنی بر ویژگیهای مورفولوژیکی و مولکولی
Ali Ammarellou
amarlou@znu.ac.ir
1
Pablo Alvarado
2
Assistant Prof., Department of Biotechnology, Research Institute of Modern Biological
Researcher, ALVALAB, La Rochela 47, 39012 Santander, Spain
Truffles are the most delicious, rare and most expensive edible fungi in the world. Interest on truffles has continuously grown in Iran during the past two decades. The oldest data on Iranian truffles were reported by Chatin who proposed the names Terfezia aphroditis Chatin and T. hanotauxii Chatin for samples collected in Iran (Chatin 1897, Esfandiari & Petrak 1950).During the last 70 years, several species have been added to the checklist of Iran’s desert truffles (Daneshpajuh 1991, Ammarellou et al. 2014, Jamali 2016).
قارچهای دنبلان از لذیذترین، نادرترین و گرانترین قارچهای خوراکی دنیا میباشند. در ادامه پژوهشهای مستمر روی دنبلانهای کوهی ایران، نمونههایی از قارچهای دنبلان جنگلی از مناطقی از استان گلستان در تابستان 1395 طی پیمایش کشوری رویشگاههای آنها مشاهده گردید که بخشی از مطالعات مربوطه در ایران و بخش تکمیلی آن در اسپانیا انجام گرفت. براساس ویژگیهای ماکروسکوپی، میکروسکوپی و مولکولی، این قارچ با نام علمی T. aestivum var. uncinatum برای نخستین بار از ایران گزارش و با شماره دسترسی IR-ZN 1395 C در کلکسیون قارچهای دنبلان پژوهشکده فناوریهای نوین زیستی دانشگاه زنجان نگهداری میشود.
https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_116007_aac0b3f4396ead9069c688de4edb0286.pdf
--
--