Genetic diversity of Neotyphodium fungal endophytes in three Iranian grass species using AFLP molecular markers

Document Type: Research Paper

Authors

1 College of Agriculture, Isfahan University of Technology

2 College of Agriculture, Isfahan University of Technology E-mail: sharifna@cc.iut.ac.ir

Abstract

Genetic diversity of fungal endophytes, Neotyphodium species, was studied in grasses Festuca arundinacea, F. pratensis and Lolium perenne using AFLP  markers. Fungi were isolated from the host leaf sheaths and Neotyphodium species were selected based on morphological characteristics. To confirm identity of selected fungi belonging to the genus Neotyphodium, polymerase chain reaction was performed using specific primers. AFLP with eight primer combinations was conducted to assess genetic variation for endophyte isolates. Cluster analysis based on AFLP data placed isolates into three separate groups according to their host species. 

Keywords


Article Title [Persian]

تنوع ژنتیکی قارچ های اندوفیت از جنس Neotyphodium در سه گونه از گندمیان ایران با استفاده از نشانگر های مولکولی AFLP

Authors [Persian]

  • سمیه کریمی 1
  • آقا فخر میرلوحی 1
  • بدرالدین ابراهیم سید طباطبایی 1
  • بهرام شریف نبی 2
1 دانشکده کشاورزی دانشگاه صنعتی اصفهان
2 دانشکده کشاورزی دانشگاه صنعتی اصفهان E-mail: sharifna@cc.iut.ac.ir
Abstract [Persian]

در این پژوهش، تنوع ژنتیکی قارچ ‌های اندوفیت از جنس Neotyphodium در گندمیان Festuca arundinacea،F. pratensis وLolium prenne با استفاده از نشانگر های مولکولی AFLP مورد بررسی قرار گرفت. بدین منظور قارچ های اندوفیت از غلاف برگ گیاهان جدا و خالص سازی شدند. براساس خصوصیات مورفولوژیکی قارچ های اندوفیت جنس Neotyphodium انتخاب گردید. ترکیب آغازگری IS3/IS1 با قارچ های انتخابی، باند 444 جفت بازی که اختصاصی جنس Neotyphodium است را تکثیر نمود که موید شناسایی درست مورفولوژیک جنس قارچ های  مورد  نظر بود.

Keywords [Persian]

  • گندمیان
  • قارچ Neotyphodium
  • Festuca
  • همزیستی
  • AFLP