APPLICATION OF 5.8 S GENE AND ITS, PCR-RFLP PATTERNS IN TAXONOMY OF NEOTYPHODIUM ENDOPHYTIC FUNGI

Document Type: Research Paper

Authors

1 Former graduate student of Plant Pathology College of Agriculture, Isfahan Univ. of Technology, Isfahan, Iran

2 Associate Prof. of Plant Breeding, College of Agriculture, Isfahan Univ. of Technology, Isfahan, Iran (E-mail: mirlohi@cc.iut.ac.ir)

3 Assist. Prof. of Mycology College of Agriculture, Isfahan Univ. of Technology, Isfahan, Iran (E-mail: sharifna@cc.iut.ac.ir),

Abstract

Endophytic fungi have mutualistic relationship with the plant family Poaceae. These fungi confer characteristics such as yield increase and biotic and abiotic stress resistance to host plants. Endophytes are classified in the familyClavicipitaceae. The endophytes spend all their life cycle in the aerial parts of plant hosts and live intercellularly. In the present investigation, endophytic fungi were isolated from seed and leaf sheath of Festuca arundinaceae, F. ovina, F. pratensis, Bromus tomentellus, Melica persica and Lolium prenne. Genomic DNA was extracted and three sets of primers: ITS1/ITS4, IS1/IS3 and 111/112 were used to detect and identify endophytes. The results of PCR with three paires of primers indicated that most of isolates used in research were endophytic fungi belonging to Neotyphodium and isolates of F. arundinacea were N. coenophialum.

Keywords


Article Title [Persian]

کاربرد مقایسه‌ای الگوهای PCR-RFLP مناطق ITS و ژن 5.8 S در تاکسونومی قارچ‌های اندوفیت Neotyphodium

Authors [Persian]

  • سعیده دهقانپور فراشاه 1
  • آقا فخر میرلوحی 2
  • بهرام شریف نبی 3
1 دانشکده کشاورزی دانشگاه صنعتی اصفهان، اصفهان E-mail: sdfarashah@yahoo.com
2 دانشکده کشاورزی دانشگاه صنعتی اصفهان، اصفهان (E-mail: mirlohi@cc.iut.ac.ir)
3 دانشکده کشاورزی دانشگاه صنعتی اصفهان، اصفهان (E-mail: sharifnia@cc.iut.ac.ir)
Abstract [Persian]

در این پژوهش قارچ‌های اندوفیت از غلاف برگ و بذرها میزبان‌های گیاهیF. arundinacea، F. pratensis، Festuca ovina، Bromus tomentellus، Melica persica و Lolium prenne جداسازی گردید. پس از استخراج DNA ژنومی این جدایه‌ها به منظور تایید حضور گونه‌های اندوفیت از سه جفت آغازگر ITS1/ITS4، IS1/IS3 و 111/112 استفاده گردید. نتایج حاصل از PCR با این سه جفت آغازگر نشان داد که اکثر جدایه‌های مورد استفاده در این پژوهش از گروه قارچ‌های اندوفیت و از جنس Neotyphodium .

Keywords [Persian]

  • قارچ های اندوفیت
  • Neotyphodium
  • RFLP-PCR
  • تاکسونومی
منابع در متن می‌باشد.


Volume 7, Issue 1
Summer and Autumn 2006
Pages 1-16
  • Receive Date: 25 September 2005
  • Revise Date: 23 September 2006
  • Accept Date: 09 May 2006