CLASSICAL METHODS AND SPECIFIC PRIMERS IN DETECTION OF ENDOPHYTIC FUNGI IN SOME GRAMINEUOS PLANTS

Document Type: Research Paper

Authors

1 Former graduate student of Agricultural Biotechnology, College of Agriculture, Isfahan University of Technology, Isfahan 84154, Iran.

2 Assistant Professor of Mycology College of Agriculture, Isfahan University of Technology, Isfahan 84154, Iran. sharifna@cc.iut.ac.ir

3 Assosiate Professor of Plant breeding, respectively, College of Agriculture, Isfahan University of Technology, Isfahan 84154, Iran.

Abstract

Mutual relationship between endophytic fungi and some gramineuos plants is one of the recently known host-microbe interactions. Endophytic fungi are classified in class Ascomycetes, order Hypocreales, tribe Balansieae and mostly genus Neotyphodium. They are transferred into the progeny via maternal stock and have many benificial effects to their host plants, such as resistance to pests and diseases, environmental stresses such as pH fluctuation, drought, salinity and grazing. because Iran has a wide range of plant genomic resources and is known as one of the origins of gramineous plants, it is necessary to know more about endophytic fungi and their presence by using classical and molecular methods. Twenty isolates of endophytic fungi were obtained from seed and leaf sheaths of Bromus tomentellus, Lolium prenne, Festuca arundinacea and Festuca pratensis. Mycelia of endophytic fungi were observed red or pink in seed and leaf sheath when stained by Rose Bengal. The DNA of endophytic fungi was extracted by Murry and Thompson method with minor modification. In order to confirm the identity of endophytes, three universal and specific primer e. g. ITS1, ITS4, IS1, IS3, and 11-1, 11-2 were used. All isolates showed a 550-750 bp band with ITS1, ITS4 and eighteen of them showed a 444 bp band with IS1, IS3 primers, which is an indicator of Neotyphodium endophytes. when primers 11-1, 11-2 were used, a 1000 bp band was not observed in all isolates. Isolates FaSm and FpGon3 that did not have shown a 444 bp band, may probably differ from Neotyphodium endophytic fungi.  

Keywords


Article Title [Persian]

روش‌های کلاسیک و آغازگرهای اختصاصی در ردیابی قارچ‌های اندوفیت در برخی گرامینه‌های‌علفی

Authors [Persian]

  • راشین گنجعلی 1
  • بهرام شریف نبی 2
  • آقا فخر میرلوحی 3
1 دانشکده کشاورزی دانشگاه صنعتی اصفهان، منابع 84154 اصفهان.
2 دانشکده کشاورزی دانشگاه صنعتی اصفهان، منابع 84154 اصفهان. sharifna@cc.iut.ac.ir
3 دانشکده کشاورزی دانشگاه صنعتی اصفهان، منابع 84154 اصفهان
Abstract [Persian]

این تحقیق به منظور بررسی روش‌های کلاسیک و آغازگرهای اختصاصی در ردیابی قارچ‌های اندوفیت در گیاهان علفی تیره گندمیان صورت گرفت که در راستای این هدف بیست جدایه قارچ از چهار میزبان مرتعی Bromus tomentellus،Lolium prenne ،Festuca  pratensis وFestuca  arundinacea جداسازی گردید. نمونه‌ها ابتدا از طریق رنگ‌آمیزی با محلول رنگی رز بنگال از نظر حضور قارچ اندوفیت آزمایش شدند، سپس نمونه‌های حاوی قارچ روی محیط‌های کشت متفاوت کشت شدند. با توجه به تفسیر دندروگرام قارچ‌های اندوفیت در هر میزبان مشابه بودند. قارچ‌های جدا شده از F. pratensisباF. arundinacae در یک گروه قرار گرفتند که این امر نشان دهنده شباهت بیشتری بین این قارچ‌ها است.

Keywords [Persian]

  • اندوفیت
  • آغازگرهای اختصاصی
  • گرامینه‌های مرتعی
  • خصوصیات مورفولوژیکی
منابع در متن می‌باشد.