Molecular and phenotypic characterization of ascomycetous yeasts in hypersaline soils of Urmia Lake basin (NW Iran)

Document Type: Research Paper

Authors

1 PhD Student, Department of Plant Protection, Faculty of Agriculture, University of Tabriz, Tabriz, Iran (l.mokhtarnejad@gmail.com)

2 Associate Prof., Department of Plant Protection, Faculty of Agriculture, University of Tabriz, Tabriz, Iran

3 Prof., Department of Plant Protection, Faculty of Agriculture, University of Tabriz, Tabriz, Iran

Abstract

Abstract
The Urmia Lake National Park (NW Iran) represents a unique ecosystem owing to special ecological conditions prevailing the region. The Urmia Lake National Park comprises a range of normal to extreme environments, with variable range of salinity between 120-300 g/L. The present study was aimed to characterize ascomycetous yeast mycobiota inhabiting hypersaline soils in this region. Soil samples were collected from different sites in Urmia Lake basin as well as islands inside the lake. Yeast isolates were recovered using Dichloran Rose Bengal agar (DRB) + chloramphenicol culture medium. Pure cultures were established using routine microbiological techniques. Yeast isolates were identified based on the sequence data from the D1/D2 domain of nuclear ribosomal DNA. The present study reports six ascomycetous yeast species, viz., Meyerozyma guilliermondii, Metschnikowia sinensis, Debaryomyces hansenii, Debaryomyces subglobosus, Torulaspora delbrueckii and Candida baotianensis from soils of this region. A phylogeny inferred using sequence data based on the D1/D2 region clustered our isolates with the representative sequences for each of the species from GenBank. All of six species identified in this study, represent new records for the mycobiota of Iran. Additionally, Candida baotianensis, Debaryomyces subglobosus, Metschnikowia sinensi and Torulaspora delbrueckii are newly recorded from hypersaline soils throughout the world.

Keywords


Article Title [Persian]

شناسایی مولکولی و فنوتیپیکی مخمرهای آسکومیستی در خاک‌های فوق‌شور حوزه دریاچه ارومیه

Authors [Persian]

  • لاچین مختارنژاد 1
  • مهدی ارزنلو 2
  • اسداله بابای اهری 3
1 دانشجوی دکتری بیماری‌شناسی گیاهی، گروه گیاه‌پزشکی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران (l.mokhtarnejad@gmail.com)
2 دانشیار قارچ‌شناسی و بیماری‌شناسی گیاهی، گروه گیاه‌پزشکی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران
3 استاد بیماری‌شناسی گیاهی، گروه گیاه‌پزشکی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران
Abstract [Persian]

پارک ملی دریاچه ارومیه با توجه به شرایط زیست محیطی خاص حاکم بر منطقه یک اکوسیستم منحصر به فرد محسوب می‌شود. پارک ملی دریاچه ارومیه دارای طیف وسیعی از شرایط محیطی طبیعی تا فرانرمال را با محدوده غلظت نمک بین 120 تا 300 گرم در لیتر را شامل می‌شود. این مطالعه به منظور شناسایی مخمرهای آسکومیستی ساکن خاک‌های فوق‌شور در این منطقه انجام پذیرفته است. نمونه‌های خاک از بخش‌های مختلف حاشیه دریاچه و همچنین جزایر داخل آن جمع‌آوری گردید. نمونه‌های مخمر با استفاده از محیط کشت رزبنگال آگار+ کلرامفنیکل (DRB) جداسازی گردیدند. جدایه‌های مخمر براساس توالی‌یابی ناحیه D1/D2 DNA ریبوزومی شناسایی گردیدند. در این بررسی، شش گونه Meyerozyma guilliermondii، Metschnikowia sinensis، Debaryomyces hansenii، Torulaspora delbrueckii، subglobosusDebaromyces و Candida baotianensis از منطقه مذکور گزارش می‌شود. هر شش گونه شناسایی شده در این مطالعه، نخستین گزارش برای میکوبیوتای ایران محسوب می‌شود. به علاوه، گونه‌هایCandida baotianensis, Debaryomyces subglobosus, Metschnikowia sinensis و Torulaspora delbrueckii نخستین گزارش از وقوع این گونه‌ها از خاک‌های شور در دنیا می‌باشد.

Keywords [Persian]

  • شوری
  • قلمرو D1/D2
  • میکوبیوتا
  • گزارش جدید
منابع در متن می‌باشد.


Volume 16, Issue 2
Winter and Spring 2016
Pages 174-185
  • Receive Date: 01 August 2015
  • Revise Date: 16 March 2016
  • Accept Date: 22 December 2015