Phylogeny of Ononis in Iran using nuclear ribosomal DNA and chloroplast sequence data

Document Type: Research Paper

Authors

1 Assistant Prof., Department of Biology, Yadegar-e-Imam Khomeini (RAH), Shahr-e Rey Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran (golaleh.m@gmail.com, g.mostafavi@iausr.ac.ir)

2 Prof., Research Institute of Forests and Rangelands, Agricultural Research Education and Extension Organization (AREEO), P.O. Box 13185-116, Tehran, Iran

3 Assistant Prof., Department of Biology, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran

Abstract

The genus Ononis,embraces more than 85 species worldwide. In the present study, materials of two subspecies of O. spinosa from different localities of Iran alongside some other native species of the genus were included in phylogenetic analyses. In addition, over 50 accessions were obtained from GenBank. In order to clarify the exact number of subspecies of O. spinosa in Iran, datasets were obtained from sequencing of nuclear ribosomal ITS (nr DNA ITS) and trnL-F plastid (cp DNA) regions and analysed. Three taxa belonging to O. spinosa L. complex (O. spinosa subsp. leiosperma, O. spinosa subsp. antiquorum, and O. arvensis=O. spinosa subsp. arvensis) were previously reported from Iran. Based on Maximum Parsimony and Bayesian analyses of the molecular datasets, it is shown that, unlike the previous reports, Iranian O. spinosa complex belongs to only two subspecies (i.e. leiosperma and arvensis subspp.). In addition, we also found that, O. spinosa subsp. antiquorum is not present in Iran. It was also demonstrated that, seed sculpturing does not provide valuable characters in diagnosing different subspecies of O. spinosa.

Keywords


Article Title [Persian]

تبارزایی جنس Ononis براساس توالی‌های DNA ریبوزومی هسته‌ای و کلروپلاستی در ایران

Authors [Persian]

  • گلاله مصطفوی 1
  • مصطفی اسدی 2
  • ایرج مهرگان 3
1 استادیار زیست‌شناسی، سیستماتیک گیاهی، گروه زیست‌شناسی، واحد یادگار امام خمینی (ره) شهر ری، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران (golaleh.m@gmail.com, g.mostafavi@iausr.ac.ir)
2 استاد مؤسسه تحقیقات جنگل‌ها و مراتع کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، صندوق پستی 116-13185، تهران، ایران
3 استادیار زیست‌شناسی و فیلوژنی مولکولی گیاهی، گروه زیست‌شناسی، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران
Abstract [Persian]

جنس Ononis (باقلاییان)، دارای بیش از 85 گونه در سرتاسر دنیا می‌باشد. در مطالعه حاضر، مواد دو زیرگونه از نقاط متفاوت ایران به همراه تعدادی از گونه‌های بومی دیگر جنس مورد تحلیل فیلوژنتیکی قرار گرفتند. به علاوه، بیش از 50 توالی نیز از بانک ژن به دست آمد. به منظور تعیین تعداد دقیق زیرگونه‌های O. spinosa در ایران، مجموعه داده‌های حاصل از توالی‌‌یابی نواحی آی.تی.اس. از دی.ان.ای. ریبوزومی هسته‌ای و ناحیه پلاستیدی trnL-F (دی.ان.ای. کلروپلاستی) تحلیل شد. سه آرایه متعلق به کمپلکس گونه‌ایO. spinosa (O. spinosa subsp. leiosperma، O. spinosa subsp. antiquorum و O. arvensis=O. spinosa subsp. arvensis) قبلا از ایران گزارش شده بودند. براساس تحلیل‌های بیشینه صرفه‌جویی و استنباط بِیزیَن مجموعه داده‌های مولکولی، نشان داده شد که برخلاف گزارش‌های پیشین، کمپلکس گونه‌ای O. spinosa تنها متعلق به دو زیرگونه است (زیرگونه‌های leiosperma و arvensis). علاوه‌ بر این، مشخص شد که زیرگونه O. spinosa subsp. antiquorum در ایران نمی‌روید. همچنین، نشان داده شد که تزیینات سطح دانه نمی‌تواند صفات مناسبی را در تشخیص زیرگونه‌های مختلف O. spinosa تامین نماید.

Keywords [Persian]

  • تبارزایی مولکولی
  • تنوع گونه‌ای
  • آی.تی.اس. ریبوزومی هسته‌ای
  • سیستماتیک
  • trnL-F
منابع در متن می‌باشد.